「ヒートマップ管理」では、ワードプレスの “get_posts”関数を使って記事を取得し、一覧表示しています。
非公開にした記事は、おそらく “get_posts”で取得できなかったため一覧に出ていないのではないかと考えられます。
ヒートマップ管理での記事一覧は、毎夜間に取得更新しています。
「公開」に戻された翌日には、記事一覧に再び表示されるかと思います。
計測自体は、URLをベースに行なっていますので、アクセスがあったデータは記事の公開などに関係なく保存されます。
一覧表示されていなくても（URLに変更がなければ同一ページとして）記録されています。ご安心ください。